Το Pop Pop Kitties είναι ένα παιχνίδι που ανοίγει φούσκες με θέμα ανθρωπόμορφα γατάκια. Όπως συμβαίνει με τα περισσότερα παρόμοια παιχνίδια, ο παίκτης χρησιμοποιεί ένα πυροβόλο όπλο για να δημιουργήσει ομάδες από τρεις ή περισσότερες φυσαλίδες ή κεφάλια γατιών, για να καθαρίσει το πεδίο παιχνιδιού από όλες τις κρεμασμένες φυσαλίδες. Σε 110 επίπεδα, ο στόχος τους είναι να κερδίσουν τρία αστέρια ανά επίπεδο δημιουργώντας αυτά τα συμπλέγματα διαφορετικών χρωμάτων και φυλών γατών.
Το παιχνίδι παρέχει στον παίκτη ένα βασικό shooter που διαθέτει μια σύντομη χρυσή κεφαλή βέλους και ένα βλήμα κεφαλής. Αν και υπάρχει μια διακεκομμένη γραμμή στόχευσης, ο παίκτης πρέπει να προτρέψει το παιχνίδι να την κάνει να εμφανιστεί όταν τη χρειάζεται. Στοχεύουν την κεφαλή βέλους ή τη γραμμή στόχευσης σε μια ομάδα δύο ή περισσότερων συνδεδεμένων κεφαλών που ταιριάζουν με το βλήμα και στη συνέχεια πυροβολούν.
Ο παίκτης ξεκινά το παιχνίδι με τρία αστέρια σε μια μπάρα χρονομέτρου στην κάτω δεξιά περιοχή που μειώνεται γρήγορα. Πρέπει να πυροβολήσει γρήγορα τις κεφαλές των βλημάτων γατάκι για να αποφύγει την απώλεια αστεριών. Όταν στοχεύουν και πυροβολούν με ακρίβεια, τα κεφάλια σκάνε με λάμψεις φωτός.
Το Pop Pop Kitties προσφέρει στον παίκτη ένα ενισχυτικό που λειτουργεί σαν βόμβα. Εμφανίζεται ως ένα λαμπερό στρογγυλό αστέρι αφού ο παίκτης σκάσει αρκετές φυσαλίδες κεφαλιών.