O Pop Pop Kitties é um jogo de rebentar bolhas com um tema de gatinhos antropomórficos. Como na maioria dos jogos semelhantes, o jogador usa um disparador para criar grupos de três ou mais bolhas, ou cabeças de gatinhos, para limpar o campo de jogo de todas as bolhas penduradas. Ao longo de 110 níveis, o seu objetivo é ganhar três estrelas por nível, criando estes grupos de diferentes cores e raças de gatos.
O jogo oferece ao jogador um atirador básico com uma seta dourada curta e um projétil de cabeça. Embora exista uma linha de mira pontilhada, o jogador tem de pedir ao jogo que a faça aparecer quando precisar dela. Aponta a ponta da seta ou a linha de mira para um grupo de duas ou mais cabeças ligadas que correspondam ao projétil e dispara.
O jogador começa o jogo com três estrelas numa barra de tempo no canto inferior direito que diminui rapidamente. Tem de disparar rapidamente sobre as cabeças do projétil do gatinho para evitar perder estrelas. Quando ele mira e atira com precisão, as cabeças aparecem em flashes de luz.
Pop Pop Kitties oferece ao jogador um impulsionador que funciona como uma bomba. Aparece como uma estrela redonda brilhante depois de o jogador rebentar um número suficiente de cabeças de bolhas.
