Pop Pop Kitties adalah gim meletuskan gelembung dengan tema anak kucing antropomorfik. Seperti kebanyakan game serupa, pemain menggunakan penembak untuk membuat kelompok tiga atau lebih gelembung, atau kepala anak kucing, untuk membersihkan arena permainan dari semua gelembung yang menggantung. Di 110 level, tujuan mereka adalah untuk mendapatkan tiga bintang per level dengan membuat kelompok-kelompok ini dengan warna dan ras kucing yang berbeda.
Gim ini memberi pemain penembak dasar yang menampilkan kepala panah emas pendek dan proyektil kepala. Meskipun ada garis penargetan bertitik, pemain harus meminta permainan untuk membuatnya muncul saat mereka membutuhkannya. Mereka mengarahkan mata panah atau garis penargetan ke sekelompok dua atau lebih kepala yang terhubung yang cocok dengan proyektil dan kemudian menembak.
Pemain memulai permainan dengan tiga bintang pada bilah pengatur waktu di area kanan bawah yang berkurang dengan cepat. Mereka harus menembak kepala proyektil anak kucing dengan cepat untuk mencegah kehilangan bintang. Ketika mereka membidik dan menembak dengan akurat, kepala-kepala itu akan muncul dalam kilatan cahaya.
Pop Pop Kitties menawarkan pemain sebuah booster yang berfungsi seperti bom. Penguat ini muncul sebagai bintang bulat yang bersinar setelah pemain meletuskan cukup banyak gelembung kepala.