Sea Bubble Pirates adalah gim meletuskan gelembung dengan tema petualangan bajak laut. Dari level ke level di jalan berliku di lanskap pasir yang dipenuhi harta karun dan monster laut, pemain membantu bajak laut meletuskan gelembung semi-transparan untuk mengumpulkan koin emas raksasa, poin, bintang, dan hadiah lainnya.
Permainan ini menyebarkan barang rampasan bajak laut di antara gelembung-gelembung yang tergantung dalam barisan berpola di lapangan permainan di dekat kapal bajak laut dan lautan. Pemain menggunakan meriam kapal hitam sebagai penembak. Mereka hanya dapat meletuskan gelembung dalam kelompok tiga yang terdiri dari setidaknya dua gelembung yang saling terhubung di lapangan dan proyektil yang cocok. Meriam ini memiliki garis bidik putus-putus berwarna merah dengan target X yang menandai tempat dan proyektil yang dapat ditukar. Proyektil utama berada di dalam meriam, dan proyektil sekunder berada di kanan bawah meriam. Pemain dapat menukar proyektil dengan memilih proyektil sekunder.
Sea Bubble Pirates memberi pemain bom hitam yang kuat yang ditandai dengan tengkorak setiap kali mereka meledakkan cluster lima kali berturut-turut. Pemain menggunakan senjata ini bersama dengan berbagai strategi penembakan untuk membuat cluster hampir setiap saat. Misalnya, mereka menembak ke dinding samping lapangan kadang-kadang untuk mengarahkan proyektil agar mengenai cluster yang lebih tinggi untuk meletuskan lebih banyak gelembung lebih cepat. Jika pemain menembak dengan cepat dan cukup akurat, mereka juga menerima tiga bintang sebagai hadiah pencapaian keterampilan untuk setiap level.
