Sea Bubble Pirates é um jogo de rebentar bolhas com um tema de aventura pirata. De nível para nível, num caminho sinuoso numa paisagem de areia repleta de tesouros enterrados e monstros marinhos, o jogador ajuda os piratas a rebentar bolhas semi-translúcidas para recolher moedas de ouro gigantes, pontos, estrelas e outras recompensas.
O jogo distribui o saque dos piratas entre as bolhas penduradas em filas padronizadas num campo de jogo perto de um navio pirata e do oceano. O jogador usa um canhão de navio preto como atirador. Só pode rebentar bolhas em grupos de três que incluam, pelo menos, duas bolhas iguais ligadas no campo e um projétil igual. O canhão tem uma linha de mira a tracejado vermelho com um alvo em X a marcar o local e projécteis que podem ser trocados. O projétil principal repousa no canhão e o secundário encontra-se no canto inferior direito do canhão. O jogador pode trocar os projécteis seleccionando o secundário.
O Sea Bubble Pirates fornece ao jogador uma poderosa bomba preta marcada com uma caveira sempre que ele estourar aglomerados cinco vezes seguidas. O jogador usa estas armas juntamente com várias estratégias de tiro para criar aglomerados quase sempre. Por exemplo, por vezes, dispara contra as paredes laterais do campo para inclinar os projécteis de modo a atingir aglomerados mais altos e rebentar mais bolhas mais rapidamente. Se o jogador disparar com rapidez e precisão suficientes, também recebe três estrelas como recompensa por cada nível.
