Bubble Hamsters é um jogo de rebentar bolhas que apresenta hamsters adoráveis a tentar apanhar sementes de girassol presas em bolhas. Está um dia brilhante e solarengo com nuvens a flutuar suavemente, mas o Robert Jr. e a Missy não podem desfrutar dele. Eles não conseguem recolher sementes de girassol suficientes sem a ajuda do jogador. Eles precisam que o jogador atire com precisão nas bolhas que contêm as sementes, usando uma besta com uma seta tipo parafuso. O jogador completa a tarefa em cada nível quando ganha um número específico de pontos e liberta todas as sementes das filas de bolhas penduradas no céu.
O jogador só pode rebentar três ou mais bolhas da mesma cor com projécteis lançados pelo atirador. Pode trocar os projécteis a qualquer momento, seleccionando o secundário num suporte próximo, marcado com riscas vermelhas e brancas num círculo e energia dourada em redemoinho. Se o jogador se sair bem, as sementes caem das bolhas rebentadas. Se demorarem demasiado tempo, o jogo deixa cair outra fila horizontal de bolhas no campo de jogo. Se as filas atingirem uma linha tracejada perto do atirador, o jogo termina.
Dito isto, o Bubble Hamsters fornece ao jogador ferramentas que ajudam a tornar o processo de recolha mais fácil. Fornece uma linha de mira feita de pontos de cor creme para apontar para bolhas específicas e espaços entre bolhas. Fornece também uma bolha estrela especial que liberta todas as sementes com um só golpe e recompensa com pontos de bónus os jogadores que rebentarem grupos de bolhas um determinado número de vezes consecutivas.
Aviso
Se o jogador visitar o ecrã inicial por qualquer motivo, o jogo pode repor o seu progresso para o Nível 1. Se isso acontecer, o jogador deve recomeçar do início.