Endless Bubbles es un juego de disparar burbujas. Con el telón de fondo de una invasión alienígena nocturna, el jugador intenta conseguir la mayor puntuación disparando proyectiles para reventar grupos de tres o más burbujas iguales conectadas entre sí. Como indica el nombre del juego, se trata de una experiencia sin fin, a menos que el jugador permita que las burbujas se deslicen por el campo de juego hasta que una descienda por debajo de la altura de la burbuja del proyectil o, simplemente, abandone por hoy.
El jugador no utiliza una flecha, un cañón, un anillo o un tirador clásico similar, ni un sistema que le permita cargar o intercambiar proyectiles. En su lugar, reciben un proyectil en el borde inferior del campo, en el centro, y vistas previas de los tres siguientes proyectiles disponibles debajo del campo. El juego también pone a disposición del jugador un reflector esmerilado que se estrecha hasta un punto como opción de puntería. Cuando el jugador utiliza con éxito el proyectil para crear un racimo, las burbujas estallan y liberan puntos que fluyen hacia una zona superior central sobre el campo.
Endless Bubbles tiene un sistema de pase libre, lo que significa que permite al jugador no reventar burbujas libremente sin penalización hasta cinco veces. A diferencia de los juegos que utilizan la desaparición de bolas comúnmente grises o gris plateado para marcar estos pases, este juego presenta un icono de energía en forma de rayo y un número que disminuye cada vez. Cuando el jugador recibe finalmente una penalización, una nueva fila de burbujas aparece en la pantalla y el juego le da más pases.
