Endless Bubbles é um jogo de atirar bolhas. Tendo como pano de fundo uma invasão alienígena nocturna, o jogador tenta obter a pontuação mais elevada de sempre, disparando projécteis para rebentar grupos de três ou mais bolhas ligadas e iguais. Como o nome do jogo indica, é uma experiência interminável, a menos que o jogador permita que as bolhas deslizem pelo campo de jogo até que uma fique abaixo da altura da bolha do projétil ou simplesmente desista do dia.
O jogador não usa uma flecha, um canhão, um anel ou um atirador clássico semelhante, nem um sistema que lhe permita carregar ou trocar projécteis. Em vez disso, recebe um projétil na extremidade inferior do campo no centro e pré-visualizações dos três projécteis seguintes disponíveis por baixo do campo. O jogo também disponibiliza um holofote fosco que se afunila até um ponto como opção de mira. Quando o jogador usa com sucesso o projétil para criar um aglomerado, as bolhas rebentam e libertam pontos que fluem para uma área superior central acima do campo.
Endless Bubbles tem um sistema de passe livre, o que significa que permite ao jogador deixar de rebentar as bolhas livremente sem penalização até cinco vezes. Ao contrário dos jogos que utilizam o desaparecimento de bolas cinzentas ou cinzentas-prateadas para assinalar estes passes, este jogo apresenta um ícone de energia de um relâmpago e um número que diminui de cada vez. Quando o jogador recebe finalmente uma penalização, uma nova fila de bolhas surge no ecrã e o jogo dá-lhe mais passes.
