Endless Bubbles est un jeu de tir à bulles. Sur fond d`invasion extraterrestre nocturne, le joueur tente d`obtenir le meilleur score possible en lançant des projectiles pour faire éclater des groupes d`au moins trois bulles connectées et assorties. Comme le nom du jeu l`indique, il s`agit d`une expérience sans fin, à moins que le joueur ne laisse les bulles glisser le long du terrain de jeu jusqu`à ce que l`une d`entre elles descende en dessous de la hauteur de la bulle de projectile ou qu`il abandonne tout simplement la partie pour la journée.
Le joueur n`utilise pas de flèche, de canon, d`anneau ou de tireur classique similaire, ni de système lui permettant de charger ou d`échanger des projectiles. Au lieu de cela, il reçoit un projectile sur le bord inférieur du champ au centre et des aperçus des trois prochains projectiles disponibles sous le champ. Le jeu propose également un projecteur givré qui se rétrécit jusqu`à la pointe comme option de ciblage. Lorsque le joueur réussit à utiliser le projectile pour créer une grappe, les bulles éclatent et libèrent des points qui s`écoulent vers une zone centrale supérieure au-dessus du champ.
Endless Bubbles dispose d`un système de laissez-passer, ce qui signifie qu`il permet au joueur d`échouer à faire éclater les bulles librement sans pénalité jusqu`à cinq fois. Contrairement aux jeux qui utilisent la disparition de boules généralement grises ou gris argenté pour marquer ces passes, ce jeu présente une icône d`énergie en forme d`éclair et un nombre qui diminue à chaque fois. Lorsque le joueur reçoit enfin une pénalité, une nouvelle rangée de bulles s`affiche à l`écran et le jeu lui accorde d`autres passes.