Bubble Shooter: Ιστορία είναι ένα shooter φούσκα που διαθέτει ένα θέμα περιπέτειας ταξιδεύουν. Μια αξιολάτρευτη καφέ αρκούδα που οδηγεί ένα αερόστατο προσκαλεί τον παίκτη να επισκεφθεί συναρπαστικές τοποθεσίες σε αιωρούμενα, νησιωτικά εδάφη στον ουρανό και στο διάστημα. Ο παίκτης ταξιδεύει από το ένα επίπεδο ή στάδιο στο άλλο, ολοκληρώνοντας συγκεκριμένους στόχους που σχετίζονται με τον πυροβολισμό φυσαλίδων που κρέμονται σε ένα πεδίο παιχνιδιού, όπως η αποκάλυψη φώτων πίσω από τις φυσαλίδες, το χτύπημα περιστρεφόμενων στόχων και η απελευθέρωση ζώων μέσα σε φυσαλίδες. Μπορούν να αφαιρέσουν φυσαλίδες από το πεδίο μόνο δημιουργώντας ομάδες από τρεις ίδιες με βλήματα.
Το παιχνίδι προσφέρει ώρες διασκέδασης σε 75 στάδια. Σε κάθε στάδιο, ο παίκτης εκτοξεύει βλήματα φυσαλίδων χρησιμοποιώντας ένα ασημένιο-γκρι μεταλλικό κανόνι που έχει πάντα μέσα του δύο εναλλάξιμα βλήματα. Υπάρχει ένα προαιρετικό ενισχυτικό διακεκομμένης γραμμής που βοηθάει στη στόχευση συνδεδεμένων φυσαλίδων ώστε να σχηματίζονται ταιριαστές ομάδες. Όταν ο παίκτης πετύχει επιτυχώς έναν στόχο, οι φυσαλίδες σκάνε. Όλες οι φυσαλίδες που συνδέονται μόνο με αυτές τις φυσαλίδες πέφτουν σε αντίστοιχα κύπελλα με κίτρινες πινελιές που βρίσκονται γύρω από το κανόνι. Οι επιπλέον φυσαλίδες παρέχουν στον παίκτη πόντους μπόνους.
Bubble Shooter: Story προσφέρει περισσότερα από ένα booster. Ο παίκτης μπορεί να χρησιμοποιήσει βόμβες για να αφαιρέσει κάποιες φυσαλίδες ή φυσαλίδες ουράνιου τόξου για να ταιριάξει με οποιεσδήποτε φυσαλίδες. Μπορούν επίσης να προσθέσουν πέντε επιπλέον βλήματα στο συνολικό τους κονδύλι. Αγοράζουν αυτά τα ενισχυτικά με κέρματα που λαμβάνουν κάθε φορά που ολοκληρώνουν έναν στόχο και ένα στάδιο. Ο παίκτης παρακολουθεί τα νομίσματά του στην αριστερή πλευρά της οθόνης. Παρακολουθούν επίσης αν βρίσκονται εντός στόχου για να λάβουν τρία αστέρια ανά στάδιο μέσω μιας κόκκινης μπάρας προόδου που γεμίζει σε μια οριζόντια μπάρα με ετικέτες τριών αστέρων.
