Bubble Shooter: Story - это бабл-шутер на тему приключений-путешествий. Очаровательный бурый медведь на воздушном шаре приглашает игрока посетить захватывающие места на плавучих, похожих на острова земных массивах в небе и космосе. Игрок переходит от одного уровня или этапа к другому, выполняя определенные задачи, связанные со стрельбой по пузырям, висящим на игровом поле, например, открывая свет за пузырями, поражая вращающиеся мишени и выпуская животных в пузырях. Убрать пузыри с поля можно, только создавая группы из трех одинаковых пузырей с помощью снарядов.
Игра включает в себя 75 этапов. На каждом этапе игрок стреляет снарядами из пузырей с помощью серебристо-серой металлической пушки, в которой всегда есть два сменных снаряда. Дополнительный бустер в виде пунктирной линии помогает нацеливать соединенные пузыри, чтобы сформировать подходящие группы. Когда игрок успешно попадает в цель, пузыри лопаются. Все пузырьки, связанные только с ней, падают в соответствующие чаши с желтой окантовкой, расположенные вокруг пушки. Дополнительные пузыри приносят игроку бонусные очки.
В игре Bubble Shooter: Story предлагает не один бустер. Игрок может использовать бомбы, чтобы уничтожить несколько пузырьков, или радужные пузырьки, чтобы совместить их с любыми другими пузырьками. Также можно добавить пять дополнительных снарядов к общему количеству. Эти бустеры приобретаются за монеты, которые игрок получает при каждом прохождении цели и этапа. Игрок отслеживает количество монет в левой части экрана. Кроме того, по красной шкале прогресса, которая заполняется на горизонтальной полосе с тремя звездами, игрок может определить, насколько он успевает получить три звезды за этап.
