Magic Bubbles είναι ένα shooter φούσκα που απαιτεί από έναν παίκτη να καθαρίσει playfields και να εκτελέσει άλλες εργασίες από popping φυσαλίδες μέσα σε έναν περιορισμένο αριθμό κινήσεων. Ανάμεσα στα σύννεφα στον ουρανό πάνω από μια μαγική χώρα, ο παίκτης ακολουθεί ένα ελικοειδές μονοπάτι για να αποκτήσει πρόσβαση στα πολλά επίπεδα του παιχνιδιού μέσω κουμπιών.
Στο πεδίο παιχνιδιού, το παιχνίδι εμφανίζει ένα κρεμαστό μοτίβο από ανάμεικτες φυσαλίδες που μοιάζουν με μπάλες. Ο παίκτης χρησιμοποιεί έναν δακτύλιο βολής και βλήματα για να δημιουργήσει συστάδες από τρεις ή περισσότερες ταιριαστές φυσαλίδες. Όταν σκάσει ένα σύμπλεγμα, λαμβάνει πόντους και προχωρά προς την απόκτηση τριών αστεριών επίτευξης για το επίπεδο και άλλων ανταμοιβών. Τα επίπεδα συνήθως διαθέτουν επίσης πολύπλοκες προκλήσεις. Ο παίκτης μπορεί να πρέπει να καθαρίσει μόνος του ολόκληρο το πεδίο ή να στοχεύσει και να σκάσει ορισμένες φυσαλίδες.
Το Magic Bubbles προσφέρει διάφορες μεθόδους για να ολοκληρώσει ο παίκτης την αποστολή του μέσα στον αριθμό κινήσεων που αναφέρεται στο κέντρο του ring shooter. Μπορούν να ανταλλάξουν τα δύο βλήματα που εμφανίζονται ανά πάσα στιγμή για να αυξήσουν την πιθανότητα κάθε βολή που κάνουν να καταλήγει σε ένα σκάσιμο που θα σκάσει. Μπορούν να χρησιμοποιήσουν μια γραμμή στόχευσης λέιζερ για να εγγυηθούν απευθείας χτυπήματα. Το παιχνίδι προσφέρει επίσης διάφορα ενισχυτικά αφού ο παίκτης ολοκληρώσει έναν συγκεκριμένο αριθμό επιπέδων, συμπεριλαμβανομένων βομβών, βομβών λέιζερ και πυραύλων.
Ο παίκτης κερδίζει νομίσματα για την πραγματοποίηση χρήσιμων αγορών. Το παιχνίδι τον ανταμείβει μερικές φορές με νομίσματα και ενισχυτές.
