Magic Bubbles ist ein Bubble-Shooter, bei dem der Spieler Spielfelder abräumen und andere Aufgaben erfüllen muss, indem er Blasen innerhalb einer begrenzten Anzahl von Zügen zum Platzen bringt. Zwischen den Wolken am Himmel über einem magischen Land folgt der Spieler einem verschlungenen Pfad, um mit Hilfe von Knöpfen die vielen Ebenen des Spiels zu erreichen.
Auf dem Spielfeld zeigt das Spiel ein hängendes Muster aus gemischten Blasen, die wie Kugeln aussehen. Der Spieler benutzt einen Ring und Geschosse, um Gruppen von drei oder mehr passenden Blasen zu bilden. Wenn er eine Gruppe zum Platzen bringt, erhält er Punkte und kann sich drei Sterne für den Level und andere Belohnungen verdienen. Die Levels bieten in der Regel auch komplexe Herausforderungen. So kann es sein, dass der Spieler das gesamte Spielfeld allein abräumen oder bestimmte Blasen anvisieren und zum Platzen bringen muss.
Magic Bubbles bietet dem Spieler mehrere Möglichkeiten, seine Aufgabe innerhalb der in der Mitte des Ring-Shooters angegebenen Anzahl von Zügen zu erfüllen. Er kann die beiden angezeigten Projektile jederzeit vertauschen, um die Chance zu erhöhen, dass jeder Schuss mit einem geplatzten Cluster endet. Sie können eine Laser-Ziellinie verwenden, um direkte Treffer zu garantieren. Das Spiel bietet außerdem mehrere Booster, nachdem der Spieler eine bestimmte Anzahl von Levels abgeschlossen hat, darunter Bomben, Laserbomben und Raketen.
Der Spieler verdient Münzen, um hilfreiche Einkäufe zu tätigen. Das Spiel belohnt ihn manchmal mit Münzen und Boostern.
