Just Bubbles adalah penembak gelembung yang menekankan bahwa target utamanya adalah "hanya gelembung." Seperti halnya penembak gelembung lainnya, pemain harus meletuskan gelembung untuk mencapai pencapaian yang memberi mereka hadiah dan poin. Bergantung pada mode permainan (yaitu, Endless, Merge, Strategy, atau Survival), game ini juga memberikan tugas-tugas lain.
Setiap mode memiliki keunikan tersendiri. Mode Endless memungkinkan pemain untuk bersantai dengan meletuskan kelompok yang terdiri dari tiga atau lebih gelembung yang cocok tanpa batas waktu atau persyaratan yang membuat stres. Dengan Merge, mereka menggabungkan pasangan gelembung untuk mendapatkan poin. Dengan Strategi, mereka berusaha meletuskan semua gelembung tanpa menggunakan banyak gerakan. Mode ini menghukum pemain setiap kali mereka menembak tanpa meletuskan cluster. Mode Survival membuat gelembung jatuh dengan cepat di lapangan. Pemain menerima beberapa tujuan yang harus mereka selesaikan sambil berusaha bermain selama mungkin untuk mendapatkan skor tinggi.
Just Bubbles menawarkan beberapa alat pendorong untuk membantu pemain menghilangkan kelompok besar dan gelembung longsoran yang tidak cocok dari lapangan. Alat-alat ini termasuk bom peledak, sinar laser yang menyala, senapan sniper, dan bola pelangi.
Jika pemain membiarkan gelembung jatuh ke dasar lapangan kapan saja, mereka akan kehilangan permainan dan harus mengulang mode.