Just Bubbles - это шутер с пузырьками, в котором подчеркивается, что главная цель - это "просто пузырьки". Как и в других бабл-шутерах, игрок должен лопать пузыри, чтобы получить достижения, за которые начисляются награды и очки. В зависимости от режима игры (Бесконечный, Слияние, Стратегия или Выживание) перед игроком ставятся и другие задачи.
Каждый режим уникален. Бесконечный режим позволяет игроку расслабиться, собирая кластеры из трех и более одинаковых пузырьков без ограничения по времени или других напряженных требований. В режиме Merge игроки объединяют пары пузырей, чтобы заработать очки. В режиме Strategy игрок пытается собрать все пузыри, не используя много ходов. В этом режиме игрок штрафуется за каждый выстрел, не попавший в скопление. Режим "Выживание" заставляет пузыри быстро падать вниз по полю. Игрок получает несколько целей, которые он должен выполнить, одновременно пытаясь играть как можно дольше, чтобы заработать высокий балл.
В игре Just Bubbles есть несколько вспомогательных инструментов, которые помогут игроку убрать с поля большие скопления и несовпадающие лавинные пузыри. Среди них взрывные бомбы, горящие лазерные лучи, снайперские винтовки и радужные шары.
Если игрок позволит пузырям опуститься на дно поля в любой момент, он проиграет игру и должен будет перезапустить режим.