Alien Bubbles είναι ένα shooter φούσκα που έχει arcade στοιχεία. Διαθέτει επίσης έναν δεινόσαυρο και κάποιο gameplay παρόμοιο με το Puzzle Bobble (Bust-a-Move). Εχθρικά εξωγήινα κεφάλια διαφορετικών χρωμάτων έχουν αποφασίσει να επιτεθούν! Ο παίκτης πρέπει να εξοντώσει τους εξωγήινους με διάφορα όπλα για να αποτρέψει αυτά τα τέρατα από το να βλάψουν τον δεινόσαυρο.
Ο παίκτης λαμβάνει ένα μηχανικού τύπου shooter φτιαγμένο με ένα γιγαντιαίο γρανάζι. Λαμβάνει επίσης χρωματιστά βέλη τύπου μπουλονιού. Μπορούν να εναλλάσσουν ανά πάσα στιγμή τα χρωματιστά βέλη για να ταιριάζουν καλύτερα με το κοντινότερο χρώμα των κεφαλιών των εξωγήινων. Μπορούν επίσης να επιλέξουν και άλλους τύπους όπλων, όπως ένα ειδικό βέλος από κρύσταλλο σε χρώματα ουράνιου τόξου και λευκού που εκτοξεύει μια ευθεία διαδρομή μέσα από κεφάλια οποιουδήποτε χρώματος και ένα μαύρο βέλος βόμβα με σημάδι κρανίου που εξουδετερώνει κεφάλια οποιουδήποτε χρώματος σε μια ακτίνα έκρηξης. Αν εξαντλήσουν τον περιορισμένο αριθμό ειδικών βελών, πρέπει να ολοκληρώσουν την αποστολή τους με τα υπόλοιπα κανονικά βέλη. Τούτου λεχθέντος, μπορούν να αποκτήσουν επιπλέον βέλη παρακολουθώντας διαφημιστικά βίντεο.
Το Alien Bubbles δεν αστειεύεται όταν πρόκειται για την απειλή που αποτελούν οι εξωγήινοι για τον δεινόσαυρο και την πιθανότητα νίκης του παίκτη. Αν τα κεφάλια, τα οποία γλιστρούν στην οθόνη με τρόπο παρόμοιο με τα κλασικά παιχνίδια με φυσαλίδες, φτάσουν στον δεινόσαυρο, ο τελευταίος καίγεται μέχρι να μείνει μόνο στάχτη στην οθόνη. Τα κεφάλια επίσης εκρήγνυνται, γεγονός που αφαιρεί τα πάντα. Αν ο παίκτης χτυπήσει ένα κεφάλι εξωγήινου με το λάθος χρώμα βέλους, όλα τα κεφάλια γλιστρούν πιο γρήγορα προς τα κάτω στην οθόνη.
Όταν ο παίκτης απομακρύνει κάθε εχθρό από το πεδίο παιχνιδιού, κερδίζει πόντους και πρόσβαση σε νέα επίπεδα δυσκολίας και φόντα.
