Alien Bubbles è uno sparabolle con elementi arcade. Presenta anche un dinosauro e un gameplay simile a Puzzle Bobble (Bust-a-Move). Teste aliene nemiche di diversi colori hanno deciso di attaccare! Il giocatore deve eliminare gli alieni con varie armi per evitare che questi mostri facciano del male al dinosauro.
Completano il gioco
Il giocatore riceve uno sparatutto in stile meccanico realizzato con un ingranaggio gigante. Riceve anche una freccia colorata in stile bolt. Può passare da una freccia colorata all`altra in qualsiasi momento per adattarsi al meglio al colore più vicino delle teste degli alieni. Possono anche selezionare altri tipi di armi, come una speciale freccia di cristallo bianca e arcobaleno che spara una traiettoria dritta attraverso teste di qualsiasi colore e una freccia bomba nera con un teschio che elimina teste di qualsiasi colore nel raggio dell`esplosione. Se esauriscono il numero limitato di frecce speciali, devono completare la missione con le frecce normali rimanenti. Detto questo, possono acquisire frecce extra guardando i video pubblicitari.
Ci sono anche delle frecce speciali.
Alien Bubbles non scherza quando si tratta della minaccia che gli alieni rappresentano per il dinosauro e per le possibilità di vittoria del giocatore. Se le teste, che scorrono sullo schermo in modo simile ai classici giochi di spara-bolle, raggiungono il dinosauro, quest`ultimo brucia fino a quando sullo schermo rimane solo cenere. Le teste inoltre esplodono, facendo fuori tutto. Se il giocatore colpisce una testa aliena con la freccia del colore sbagliato, tutte le teste scivolano più velocemente sullo schermo.
Che il giocatore elimini tutti i nemici dallo schermo.
Quando il giocatore elimina ogni nemico dal campo di gioco, guadagna punti e accede a nuovi livelli di difficoltà e sfondi.