Mahjong Alchemy är ett tidsinställt pusselspel där spelaren ska lära sig symboler relaterade till alkemi, natur och vetenskap samtidigt som han eller hon rensar en spelplan från mönster bestående av lager av götformade brickor. De får bara 15 minuter för att slutföra dessa mål.
Spelaren tar bort par av matchande oskyddade brickor som inte är blockerade på vänster eller höger sida. Götbrickorna är gjorda av ljusblå silver- eller tennmetaller och bruna koppar- eller guldmetaller. När spelaren håller muspekaren över en symbol kan han eller hon se dess namn och värde i det nedre högra hörnet.
Symbolerna inkluderar antimon, arsenik, vismut, mässing, kristall, degel, gryningssol, olika färger av drakar, fullmåne, guld, järn, bly, kvicksilver, nickel, middagssol, fosfor, silver, sprit, tenn, vinäger och vatten. Spelaren kan också lära sig symbolerna för vanliga verktyg och processer som användes av forntida alkemister. Istället för att matcha dessa symboler kan de matcha valfria brickor från respektive kategori.
Mahjong Alchemy låter spelaren ändra perspektivet på ett mönster mellan Front View (uppifrån och ned) och Perspective View (från sidan) med hjälp av menyalternativet i det övre högra hörnet. Spelaren kan också stoppa ett spel för att skicka in sin poäng och även kolla in de olika tillgängliga mönstren som inkluderar The Altar, Celtic, Stone Circle och Twin Peaks.
Spelet visar poäng och tid längst upp på fältet. Om spelaren inte lyckas vinna på grund av att tiden eller dragen tar slut, återställer spelet automatiskt mönstret till ett annat utan att starta om klockan. Annars måste spelaren starta om spelet.
